一时之间，由于双方都动用了毁灭性的力量，导致洪荒世界生灵涂炭，山河尽毁，波及范围异常巨大，神族圣人都迅速撤离战场，鬼皇百夜所带领的鬼族也因此出现了严重的伤亡，不得已之间，他们也退回到鬼族之地内躲避。
巫妖大战期间，鬼族的战斗令到对方受创，由于他们诡异的速度，让那些神族的圣人屡次被击破，巫族一方也留意到这股突然崛起的势力，但由于他们的正面对手是妖族，暂时也无暇去理会。
这段时间，鬼族虽然也因巫妖大战受到了严重的伤害，幸好的是，那名神秘的女鬼在鬼族中起到了很大的作用，她运用了一种神奇的力量，将鬼族的伤害减到最低，很好的将族员们保护起来。鬼族之地内也受到了巫妖大战的力量波及，鬼族之地内，除了奉鬼殿，大部分的区域都被摧毁，为避免再出现危险，鬼皇百夜也让所有族员迁移到奉鬼殿之内，可以说，鬼族最后所剩下的容身之地就只有这里了。
洪荒世界的天空异常的灰暗，时不时地电闪雷鸣，周围充斥着一阵阵热浪，整个世界都显得压抑无比，地面上布满了两族战争中的牺牲品。然而，两族之间的战斗并没有因此而停止下来，而是越来越激烈，妖皇太一为报兄长之仇，动用了最强的杀招，十二祖巫中最后剩下的人员也不得已全力对抗。
就这样，这两族所使用的力量已经达到了足以毁天灭地的程度，洪荒世界也受到了这股力量的影响，开始地动山摇，翻江倒海，出现了面临崩溃的情景，这样的情况持续并不久，意外的是，妖族与巫族也无法控制力量，最后都只有同归于尽的下场，洪荒世界的两个强大族群族因为这场战争而双双陨落，他们的战争还让其他族群受到了大幅度牵连，到处呈现出一片生灵涂炭的景象。这一场毁天灭地般的巫妖之战也因此被载入了洪荒时期的历史之中。
两大族群消逝之后，十二祖巫已经不复存在，至于妖族方面，也只是幸存着一部分残弱之躯，妖皇太一已经不知所踪，也许他和十妖将一起战死沙场了，但也有部分传闻，他还没死，至于是真是假就无从得知，但是从此刻开始，洪荒世界又进入到另一轮的变化之中。
经过了一段时间后，洪荒世界进入到新的一个阶段，曾经帮助过巫族的那些圣人类们，突然之间变得异常强大了起来，他们居然占据了妖族的领地，以神之名自居，他们的领导者也被称之为神皇，没过多久，便是人族的崛起，人类一族诞生的数量越来越多，他们占据了地上的世界，扩大自己的部落，洪荒时代的人类历史也正式开始，而妖族一方，就显得十分的没落，他们诞生的速度比人类要慢得多，曾经的那些残弱之辈也没有熬住，都相继消亡。
因此，后来所诞生的妖类，已经和妖皇太一所领导的妖族之辈更不能相提并论，他们属于另一种新生代物种，保留的也只有妖之名罢了，因此，后世称妖皇太一时期的妖怪为妖神，就连十二祖巫也一样，他们是洪荒世界的实力强悍的佼佼者。
为何他们会被称为“神”？这也和洪荒世界的神族有关，神族开始强盛起来，在他们的精神熏陶下，世间万物生灵都开始认为神是最高的统治者，因此到了后世，神在人们心中形成了一种无形的强大存在，一直流传至今。
但神族为何无缘无故变得如此强大？那是因为他们在巫妖大战后，获得了巫妖二族的秘宝，这些在后来被称为神器，再加上他们自身就拥有着强大的力量和智慧，所以他们眨眼之间就强盛了起来，开创了神族的历史。
相比而言，鬼皇百夜所带领的鬼族则一直留守在奉鬼殿内，似乎有点原地踏步，虽然如此，随着人族崛起，鬼族的力量也不可轻视，因为百鬼全书之前所释放的力量，让这个世界出现了变化，一切有生命之物死亡后便会化成鬼类的这一定律没有改变，因此，人类的繁殖与死亡更是无形中造就了鬼族的优势。随着时间的流动，地上的世界也涌现出一大批被称为鬼魂之物，他们也是不可以和鬼族的鬼相提并论的存在，不过他们都属于鬼类，也因此而聚集到鬼族的一方。
从那个时候开始，鬼皇百夜以及和鬼族的部分成员也可以幻化成人类的姿态，继而管理着鬼的国度，但也因为如此，引起了那些神的注意，最重要的是，他们之间迎巫妖大战结下的仇恨种子并没有消失，因此，神族暗自决定要除掉鬼皇百夜所带领的鬼族计划·······
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